Le Japon est un archipel qui s'étend le long de la côte Est de l’Asie. Cet archipel comporte quatre îles principales qui composent le pays, du Nord au Sud: Hokkaido, Honshu (la principale), Shikoku et Kyushu. L’archipel comporte environ 3 000 autres îles qui sont plus petites.
Le Japon est découpé en neuf régions qui sont (du nord au sud) : Hokkaido, Tohoku, Kanto, Chubu, Kansai (couramment appelé Kinki), Chugoku, Shikoku, Kyushu et Okinawa.
Depuis 1868, la capitale du Japon est Tokyo. Elle se trouve dans la région du Kanto. Elle est la plus grande ville du Japon, actuellement, son nombre d'habitant est de : 12 millions d'habitants sans compter les 23 arrondissements, soit 20 millions avec les arrondissements.
Le Japon est constitué de 73% de relief montagneux, le mont Fuji (volcan) est le plus haut sommet du pays avec ses 3 776 mètres. Plus d'une vingtaine de sommets des Alpes japonaises dépassent 3 000 m. Les deux plus grandes zones de plaine sont la plaine du Kantô, qui fait maintenant partie de l'agglomération de Tokyo, et la plaine du Kansai autour d'Osaka. La population japonaise est inégalement répartie sur le territoire. Près de la moitié de la population japonaise (environ 60 millions) est concentrée dans les mégalopoles de Tokyo et Osaka-Kyoto-Kobe. Par conséquent, les zones au relief accidenté restent très sauvages, et constituent des refuges naturels pour une faune nombreuse et épargnée par les activités humaines.